Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms