Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCAMP43121 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCAMP43121 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCAMP43121 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCAMP43121 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCAMP43121 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCAMP43121 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCAMP43121 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCAMP43121 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCAMP43121 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCAMP43121 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCAMP43121 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCAMP43121 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCAMP43121 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCAMP43121 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCAMP43121 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCAMP43121 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCAMP43121 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCAMP43121 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCAMP43121 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCAMP43121 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCAMP43121 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCAMP43121 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCAMP43121 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms