Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP1P32455 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP1P32455 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP1P32455 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP1P32455 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP1P32455 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP1P32455 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP1P32455 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms