Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC8P31273 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms