Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms