Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO2P25791 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO2P25791 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO2P25791 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO2P25791 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO2P25791 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO2P25791 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO2P25791 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms