Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CD247P20963 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CD247P20963 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CD247P20963 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CD247P20963 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CD247P20963 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CD247P20963 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CD247P20963 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CD247P20963 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CD247P20963 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CD247P20963 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD247P20963 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD247P20963 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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