Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms