Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms