Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms