Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RAB9BQ9NP90 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RAB9BQ9NP90 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RAB9BQ9NP90 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RAB9BQ9NP90 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RAB9BQ9NP90 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RAB9BQ9NP90 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RAB9BQ9NP90 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RAB9BQ9NP90 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RAB9BQ9NP90 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RAB9BQ9NP90 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RAB9BQ9NP90 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RAB9BQ9NP90 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RAB9BQ9NP90 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RAB9BQ9NP90 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RAB9BQ9NP90 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RAB9BQ9NP90 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RAB9BQ9NP90 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RAB9BQ9NP90 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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