Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf16Q9BUW7 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf16Q9BUW7 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf16Q9BUW7 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf16Q9BUW7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf16Q9BUW7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf16Q9BUW7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf16Q9BUW7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf16Q9BUW7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf16Q9BUW7 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf16Q9BUW7 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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