Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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SGCZQ96LD1 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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SGCZQ96LD1 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SGCZQ96LD1 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SGCZQ96LD1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SGCZQ96LD1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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SGCZQ96LD1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SGCZQ96LD1 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SGCZQ96LD1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SGCZQ96LD1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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