Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSC1Q92574 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSC1Q92574 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms