Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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