Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms