Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms