Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms