Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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