Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms