Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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