Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ATRQ13535 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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