Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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