Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SSBP1Q04837 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SSBP1Q04837 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms