Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms