Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1P60507 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1P60507 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1P60507 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1P60507 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1P60507 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1P60507 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1P60507 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1P60507 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1P60507 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1P60507 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFC1P60507 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFC1P60507 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms