Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP4P49662 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP4P49662 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP4P49662 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP4P49662 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP4P49662 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP4P49662 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP4P49662 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP4P49662 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms