Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MLH1P40692 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
MLH1P40692 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
MLH1P40692 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MLH1P40692 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms