Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA3P32297 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms