Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
APOBEC3AP31941 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms