Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB2P26583 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms