Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTSSP25774 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTSSP25774 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTSSP25774 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTSSP25774 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTSSP25774 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTSSP25774 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms