Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms