Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DESP17661 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms