Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms