Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms