Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ZBED1O96006 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ZBED1O96006 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ZBED1O96006 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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