Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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LRRTM2O43300 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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