Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ANXA3-209ENST00000512884 1335 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SMUG1-201ENST00000243112 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 EIF3K-201ENST00000248342 864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 OR8J3-201ENST00000301529 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PPP1R32-202ENST00000366212 488 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 KCNK16-202ENST00000373229 1248 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GGNBP1-201ENST00000374458 960 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 DEFA1-202ENST00000382692 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms