Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms