Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms