Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms