Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2Q8WZ74 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms