Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms