Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms