Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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WDR53Q7Z5U6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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WDR53Q7Z5U6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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WDR53Q7Z5U6 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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WDR53Q7Z5U6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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WDR53Q7Z5U6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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WDR53Q7Z5U6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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WDR53Q7Z5U6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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WDR53Q7Z5U6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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WDR53Q7Z5U6 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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