Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms