Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

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Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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CHD9Q3L8U1 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CHD9Q3L8U1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CHD9Q3L8U1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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