Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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