Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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